府城天后宮(台南聖母壇)是山上天后宮十一個分宮中,唯一的「分靈宮」。
「分香宮」與「分靈宮」是有區別的。所謂「分香宮」,係向「母廟」包香灰回去自行雕塑金身、開光點眼之後奉祀的。而「分靈宮」則由「母廟」雕塑金身,並開光合點眼之後,以恭迎回宮奉祀。
因此,「分香宮」的神尊,與「母廟」的神尊,係「母子」或「父子」關係;而「分靈宮」的神尊,與「母廟」的神尊關係,則為「姐妹」或「兄弟」,是可平起平坐的。
府城天后宮(台南聖母壇)的前身,是為「台南聖母會」其組織與演變歷程是這樣的:
話說日治末期,太平洋戰爭爆發,盟軍猛烈轟炸台灣,而古都台南,是盟軍轟炸的主要目標之一。台南居民為逃空襲,紛紛往鄉下或山區疏散。
其中有一批人潮疏散至時稱「山仔頂」的山上庄來。他們虔誠的祈求「天上聖母」保祐,戰爭能快快結束,大家能平安無事。住在山仔頂的避難日子,他們接受「山仔頂」人的真誠款待。
戰爭終於結束,台灣光復了,他們也都平安無事的回到滿目瘡痍、斷垣殘壁的府城台南,重整家園。
等到一切收拾、整建停留,他們感念起「天上聖母」的保祐,使他們得以安然歸來;他們也感謝「山仔頂」人的照顧與協助,使他們逃難在外,不致於挨餓受凍。於是他們組織了「聖母會」,出錢出力的參加「山上天后宮」的所有廟會,及社區活動。
「聖母會」的感恩回饋行動,令人動容,也令人激賞!
隨著歲月的遞嬗流轉,「聖母會」的信徒愈眾,於是有年輕輩的信徒認為,到「山仔頂」拜「媽祖」的路途遙遠,往返曠日費時,因此而建議雕塑「媽祖」金身奉祀,以便就近參拜。
於是就在「聖母會」出資,「山上天后宮」管理委員會主持下,雕塑一尊「副三媽」金身,由「聖母會」信眾恭迎奉祀於台南市忠義路二段二百一十號林崑發住宅處,並取神壇名曰:聖母壇。
不久,「聖母會」再向「山上天后宮」包香灰回去雕塑大媽、二媽、三媽、四媽及五媽等五尊金身奉祀,並遷祀於台南市富農街一段一百九十六號今廟址。
由於「府城天后宮」的「副三媽」乃是「山上天后宮」的「三媽」副身,因此在「山上天后宮」的各香科時,是所有分宮中唯一可以坐母廟「大轎」云庄遶境的。